Ubuntu 9.04ではxulrunner 1.9が入ってるらしく、これだとAptanaが動かないらしい。
そこで、xulrunner 1.8をインストールする。

sudo aptitude install xulrunner

その後、Aptanaがxulrunner 1.8を利用するように環境変数を設定して起動する。
簡単に起動するようにスクリプトを書くとこんな感じ。

#!/bin/zsh
export MOZILLA_FIVE_HOME=/usr/lib/xulrunner
~/application/aptana/AptanaStudio